Модель заводского скрэмблера Yamaha XSR900 XSR900 впервые была представлена в 2016 году и первоначально была ориентирована на рынок Америки (однако в дальнейшем модель полноценно пришла и на европейский рынок). Yamaha XSR900 XSR900 была построена на базе нейкеда MT-09, получив от нее двигатель, раму и ходовую часть. Вдохновителем дизайна XSR900 стал концепт флэт-трекера Faster Wasp от Роланда Сэндса. Как и XSR700, XSR900 относится к так называемой серии «Sport Heritage» от Yamaha.
Модель также может иметь название — Yamaha MTM850.
Главной особенностью Yamaha XSR900 является рядный 3-цилиндровый двигатель, объемом 847 куб.см., выдающий 115 л.с. мощности и 87,5 Нм крутящего момента. Мотор полностью идентичен таковому на MT-09 и показывает такие же характеристики.
Мотоцикл также оснащается алюминиевой рамой, системами ABS и трекшн-контроля, проскальзывающим сцеплением, 4-поршневыми радиальными тормозами, перевернутой вилкой и топливным баком на 14 л. Общая снаряженная масса — 195 кг.
В 2017 году для рынка некоторых европейских стран XSR900 предлагает новую модификацию — Yamaha XSR900 XSR900 Abarth. Модель представляет собой классический кафе-рейсер с полуобтекателем, низким рулем, задней частью в спортивном стиле и новым дизайном выхлопной системы с двумя трубами. По техническим характеристикам Abarth полностью идентичен обычной версии XSR900.
В конце 2021 года Yamaha представила новое поколение XSR900 2022-го модельного года. Обновленная версия получила новый внешний вид, полную LED-оптика, цветной TFT-дисплей 3,5′, новый двигатель увеличенного объема (847 → 889 см³) и производительности, новые настройки подвесок (изменение хода, передняя вилка стала полностью регулируемой), а также целый ряд электронных компонентов — Slide Control System (SCS), Wheel Lift Control System (LIF), Brake Control (BC) System, Quick Shift System (QSS) и круиз-контроль.
В 2024 году Yamaha представила новую модификацию — Yamaha XSR900 XSR900 GP. Она отличается уникальным стилем гоночных мотоциклов Yamaha 80-90х годов и спортивной эргономикой. Аббревиатура GP означает Grand Prix.